Az Identitárius Egyetemisták Szövetsége vezetősége az elnökből, az elnökhelyettesből, az országos szervezőből és a területi vezetőkből áll.

Az elnök elsődleges feladataként a központi és általános koordinációt látja el, az elnökhelyettes pedig az ebben való feladatmegosztást segíti elő. Az országos szervező a területi csoporton kívüli tagság szervezéséért, az új területi csoportok stabil működésének elősegítéséért és az esetlegesen felmerülő, a területi csoportok valamelyikét érintő problémában hivatott közreműködésével rendezettséget teremteni. A területi vezetők a területi csoportok, mint a szervezet alapegységeinek élén vezetik és szervezik a helyi közösség fejlődését és növekedését.